Довгий пептидний синтез|Налаштування довголанцюгового пептиду|Складний пептидний синтез|Пептиди понад 50 мер|Наука-Пептид

 

Метаопис

 

Потрібен довгий пептид з більш ніж 50 амінокислотами? Наука-Сервіс Long Peptide Synthesis охоплює 50-189 амінокислот із сегментованою стратегією синтезу, подолання проблем гідрофобної агрегації та низької ефективності синтезу тощо. 20 років досвіду та стабільної доставки. Ласкаво просимо до нас.

 

Довгі пептиди: чим вони довші, тим більше проблем завдають

 

Чому складно отримати довгі пептиди?
Кожен, хто займався синтезом пептидів, знає, що проблема виникає, коли пептидний ланцюг довгий: більшість компаній можуть це зробити в межах 20 амінокислот. Коли справа доходить до більш ніж 40 амінокислот, ми починаємо вибирати послідовність. При 60 амінокислотах або більше кількість компаній, які можуть взяти на себе контроль, зменшується вдвічі. Коли мова йде про понад 100 амінокислот, не так багато компаній, які наважуються це зробити.

 

чому Оскільки довгий пептидний синтез стикається з кількома підводними каменями:

Ефективність синтезу знижується: кожне подовження амінокислоти, вихід буде знижено один раз. 30 амінокислотного пептиду, кожен крок 99% виходу, кінцевий вихід все ще становить 74%; 60 амінокислот, кожна стадія все ще становить 99%, кінцевий вихід лише 55%. Насправді вихід багатьох ступенів не може досягати 99%.
Гідрофобна агрегація: коли в довгому пептиді багато гідрофобних амінокислот, пептидний ланцюг починає «злипатися» на смолі, і амінокислоти, що знаходяться за ним, не можуть увійти.


Складність очищення: час утримування довгих пептидів і домішок занадто близькі один до одного для чистого зрізу.
Погана розчинність: коли пептид отримано, його неможливо розчинити, тому експеримент неможливо провести.
Ми вже бували в цих вибоїнах і знаємо, як їх обійти.

page-800-600

 

Що ми можемо зробити

 

1. Довжина: 50-189 амінокислот

діапазон довжини

Складність

Ми робили ситуації, коли

50-80 аа

Верхній середній клас

Routine program with >90% успіху

80-120 аа

Високий

Потрібна сегментована стратегія синтезу, достатньо досвіду

120-150 аа

Дуже високий

Я зробив їх багато, до 150.

150-189 аа

Надзвичайно високий

Рівень виклику з історіями успіху

 

2. Стратегія сегментованого синтезу
Найефективніший спосіб боротьби з довгими пептидами - сегментувати їх:
Вибір сегмента: розріжте довгий пептид на 2-4 сегменти по 30-60 амінокислот кожен. Точка розрізу повинна бути розташована в місці, де синтез синтезу низький, наприклад, уникаючи суцільної гідрофобної області.
Синтез фрагментів: кожен фрагмент синтезується та очищається окремо до достатньо високого рівня чистоти.
Зрощення фрагментів: з’єднання фрагментів у розчині або на смолі. Спосіб з'єднання може бути природним хімічним або ферментативним.
Згортання: якщо пептид має дисульфідний зв’язок, він повинен бути згорнутий у правильну конформацію після сплайсингу.

 

3. Чистота: Залежно від експериментальних вимог

Рівень чистоти

Застосовні сценарії

Звичайна чистота (85-95%)

Поєднання експериментального, активного первинного скринінгу

Висока чистота (95-98%)

клітинні експерименти, функціональна перевірка

Ultrapure (>98%)

Структурні дослідження, кристалографія

 

Кожен довгий пептид супроводжується звітом ВЕРХ і MS, що робить дані про чистоту прозорими.

 

4. Модифікації: довгі пептиди також можуть додати функцію
Флуоресцентне маркування: FITC, TAMRA, хочу побачити, де проходить довгий пептид.
Біотин: витягніть-знизу або спробуйте.
Ізотопне маркування: для кількісного визначення за допомогою ЯМР або мас-спектрометрії.
Фосфорилювання/глікозилювання: імітація пост{0}}трансляційних модифікацій.

 

Чому варто прийти до нас за довготривалим синтезом пептидів?

 

1. Ми робимо це 20 років
Довгий пептидний синтез - це не те, що може зробити кожен. Протягом багатьох років ми працювали з багатьма довгими пептидами: трансмембранними білковими фрагментами, пептидами злиття вірусів, амілоїдними білками, антимікробними пептидами тощо. Ми добре розуміємо, які послідовності легко агрегувати та які умови можуть їх зберегти. Якщо ви прийшли до нас на Long Peptide Synthesis, принаймні вам не доведеться наступати на яму з самого початку.

 

2. Дробовий синтез: не просто розрізання на частини
Сегментація звучить просто, але важливо, де вирізати, довжина кожного сегмента та як їх з’єднати. У нас є кілька принципів:
Розріз у гідрофільній зоні: уникайте розрізання гідрофобного ядра, інакше сегменти збиратимуться самі.
Збалансуйте довжину фрагментів: не робіть один сегмент особливо складним для виконання, а інші — особливо легкими. 3.
Вибір точки з’єднання: для природних хімічних з’єднань потрібен тіоефір на C-кінці та Cys на N-кінці, які мають бути розроблені заздалегідь.

 

3. Гідрофобні пептиди: спеціальна система розчинників.
Деякі довгі пептиди настільки гідрофобні, що їх неможливо розчинити звичайними розчинниками, тому під час синтезу вони злипаються на смолі. Ми маємо спеціальну систему розчинників і добавки, щоб підтримувати розтягнення пептидного ланцюга під час процесу синтезу, щоб могли входити наступні амінокислоти.

 

4. Контроль якості: дані на кожному кроці
Контроль якості довгих пептидів складніший, ніж коротких пептидів:
Контроль якості проміжних продуктів: після синтезу кожного фрагмента спочатку виміряйте чистоту та молекулярну масу, а потім перейдіть до наступного кроку після проходження тесту.
Моніторинг процесу з’єднання: випробуйте реакцію з’єднання та виміряйте MS, щоб побачити ефективність з’єднання.
Перевірка кінцевого продукту: ВЕРХ на чистоту, MS на молекулярну масу, MS/MS на правильність послідовності (необов’язково).
Тест на розчинність: надайте рекомендовані розчинники та методи солюбілізації, щоб не отримати пептиди, які не розчиняються.
Виконуючи Long Peptide Synthesis, дані говорять самі за себе, і кожен крок можна відстежити.

 

5. Від міліграмів до ста міліграмів, до кінця
Міліграми для етапу скринінгу, десять міліграмів для етапу перевірки, сто міліграмів для структурного дослідження - ми можемо взяти все. Той самий проект, той самий аналог, не потрібно повторно -гармонізувати.

 

Для чого можна використовувати довгі пептиди?

 

Напрямки досліджень

Загальне використання

Ми робили ситуації, коли

мембранні білки

трансмембранні фрагменти, позаклітинні петлі

Довгий пептид з кількома трансмембранними ділянками, високогідрофобний

вірусні білки

Злиті пептиди, домени-зв’язування рецепторів

Новий фрагмент білка S коронавірусу, близько 100 аа

Амілоїд

A , -синуклеїн

42аа - норма. Довші були зроблені

Антимікробні пептиди

Довголанцюгові антимікробні пептиди

Деякі природні антимікробні пептиди мають лише 40-60 аа

цитокіни

імітація активної зони

50-80аа, з дисульфідними зв'язками

структурна біологія

ЯМР, кристалографія

Isotopically labeled peptide, purity >98%.

 

Доставка та контроль якості

 

  • Доставка: ліофілізований порошок, центрифужні пробірки або флакони, захищені азотом.
  • Супровідні документи: COA (профіль HPLC + профіль MS), MS/MS (підтвердження послідовності необов’язкове), звіт про синтез (процес сегментації та сплайсингу).
  • Додаткові тести: вміст пептидів, ендотоксин, вологість, амінокислотний склад, тест на розчинність.
  • Індивідуальна упаковка: порції та маркування відповідно до ваших вимог.
  • Перед надсиланням кожен продукт Long Peptide Synthesis двічі-перевіряється, щоб переконатися, що послідовність правильна та чистота відповідає стандартам.
page-800-1067
page-800-1067
page-800-1067

 

Три випадки-з життя

 

Випадок 1: Програма мембранних білків у науково-дослідному інституті

The customer needs a 85aa transmembrane peptide for structural study. This peptide has 60% of hydrophobic amino acids, so many companies could not make it. We used segmental synthesis, cut into three segments, each segment is about 30aa, purified and then liquid-phase ligated. The final purity of the peptide is >95%, і клієнт отримав це та зробив ЯМР.

Випадок 2: Програма вірусного білка багатонаціональної фармацевтичної компанії

A 110aa viral fusion peptide with two pairs of disulfide bonds was required for inhibitor screening. We designed a segmented synthesis strategy to synthesize three linear fragments first, which were joined and then oxidized to form disulfide bonds. The final product was delivered with >90% чистоти, правильно спарені дисульфідні зв'язки та пройшли перевірку активності.

Випадок 3: дослідження амілоїду в національному університеті

The customer needs a 70aa fragment of alpha-synuclein for the study of aggregation mechanism. This peptide is easy to form fibers and always blocked the column during purification. We optimized the mobile phase conditions, added a small amount of organic solvent, and finally obtained a product with purity >95%, і клієнт успішно виконав експерименти ThT.

 

Говорячи про ваші довгі потреби в пептидах?

 

Якщо вам потрібен трансмембранний пептид 80аа або вірусний білок 150аа, ви можете поговорити з нами. Якщо ви попросите Science-Peptide виконати Long Peptide Synthesis, принаймні вам не доведеться пробувати один за одним.

 

Мені потрібно, щоб ти сказав мені:
Послідовність пептидів (або цільова інформація)
Скільки (міліграм)
вимоги до чистоти
не мають дисульфідних зв’язків чи інших модифікацій


Коли ти цього хочеш?

Дайте вам оцінку здійсненності та запропонуйте пропозицію протягом 24 годин.